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Project: Gen贸mica de organismos acu谩ticos 
Responsable: Fabiola  Lafarga  De la Cruz
Tipo de proyecto: Proyecto Interno
Resumen: La aplicaci贸n de m茅todos gen贸micos en organismos acu谩ticos est谩 en sus comienzos, pero avanza decididamente debido a la importancia socioecon贸mica y/o ecol贸gica de estos recursos; ya sea en las actividades productivas de pesca y acuicultura, como en actividades de conservaci贸n de la biodiversidad y del acervo gen茅tico. La gen贸mica engloba un conjunto de t茅cnicas y metodolog铆as dirigidas al estudio de la estructura y funci贸n del genoma completo (o de una fracci贸n grande del mismo), en contraposici贸n al enfoque cl谩sico de la biolog铆a molecular, que s贸lo permite estudiar uno o unos pocos genes a la vez. Por ello, la gen贸mica ha revolucionado la forma de estudiar los fen贸menos biol贸gicos en organismos no modelo. 脡ste es el caso de la mayor铆a de los organismos acu谩ticos, de los cuales hay poca o nula informaci贸n gen茅tica. Por otra parte, los m茅todos gen贸micos tienen gran potencial para resolver problemas relacionados directamente con el cultivo de los organismos y facilitar el desarrollo de soluciones, biotecnol贸gicas o de otro tipo, a estos problemas. Por ejemplo, la aplicaci贸n de metodolog铆as de transcript贸mica est谩 permitiendo avanzar en el conocimiento del sistema inmune de los moluscos, y los genes implicados en la respuesta a organismos pat贸genos; as铆 como las bases gen茅ticas de la heterosis (vigor h铆brido; Saavedra & Bach猫re, 2006). M谩s a煤n, gracias al uso de herramientas gen贸micas se pueden identificar genes candidatos relacionados con las respuestas fisiol贸gicas de resistencia a enfermedades, tolerancia a estr茅s ambiental (p.ej. temperatura, salinidad, pH, etc.), desarrollo larvario, maduraci贸n gonadal, as铆 como los mecanismos moleculares de determinaci贸n de sexo y del control del crecimiento. Todos 茅stos son caracteres de inter茅s productivo en la industria acu铆cola. Por otra parte, a nivel de poblaciones silvestres, el estudio amplio del transcriptoma ha permitido identificar gen茅ticamente fenotipos con adaptaciones locales en un gran n煤mero de genes involucrados en los procesos de biomineralizaci贸n, metabolismo energ茅tico o tolerancia a temperaturas elevadas, enfermedades y niveles bajos de ox铆geno (abul贸n rojo de California; Wit et al., 2012). Estos estudios permiten evaluar la respuesta, a nivel de expresi贸n g茅nica, de los organismos silvestres en un amplio rango de condiciones ambientales e identificar zonas de alta diversidad gen茅tica (riqueza) para implementar estrategias de manejo y conservaci贸n de recursos acu谩ticos pesqueros de importancia comercial.
Considerando que la gen贸mica facilita el estudio biol贸gico de los organismos acu谩ticos e incrementa en varios 贸rdenes de magnitud la cantidad de conocimiento que se puede extraer, este proyecto plantea implementar m茅todos gen贸micos (p.ej. secuenciaci贸n masiva (RNA-Seq), genotipificado por secuenciaci贸n (GBS), entre otras) para el estudio de organismos acu谩ticos (invertebrados y peces marinos, principalmente) de inter茅s econ贸mico y ecol贸gico en Baja California, M茅xico. Con la finalidad de generar informaci贸n acerca de la arquitectura gen茅tica de los organismos, que sea aplicable en las 谩reas de acuicultura y pesquer铆as, para mejorar la producci贸n en cautiverio e implementar medidas de manejo pesquero adecuadas para la conservaci贸n de los recursos acu谩ticos.
M茅xico cuenta con un gran potencial para el desarrollo de la maricultura, gracias a sus 11,500 km de litoral con una plataforma continental de 357,800 km2 y 1.5 millones de hect谩reas en cuerpos costeros con caracter铆sticas oceanogr谩ficas apropiadas para la acuicultura, as铆 como una amplia diversidad de especies con alta demanda en el mercado nacional e internacional. De forma particular, Baja California destaca por su producci贸n de moluscos, bivalvos principalmente; y en a帽os recientes por el impulso que se ha dado al cultivo (o engorda) de peces marinos de alto valor comercial.
Vigencia: (2013-09-04 - 2014-12-31)

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